Nejlepší odpověď
Existují 3 dobré odpovědi, ale byl jsem požádán, abych k tomuto tématu přidal, abych mohl zesílit málo. „Gen“ může být regulační gen, který nekóduje bílkoviny, existuje celá řada genů. Existují geny pro tRNA, rRNA atd. ORF nebo otevřený čtecí rámec přesně odpovídá otázce – kód proteinu ORF, i když některé z nich nikdy neprodukují skutečný protein v buňce. Jeden z rozdílů mezi STRUKTURÁLNÍ gen (který produkuje protein) a ORF spočívá v tom, že existuje několik dalších látek, díky nimž je gen exprimován – například musí existovat promotorová oblast (v bakteriální DNA), která „přitahuje pozornost“ RNA polymerázy Některé ORF nemají promotor, takže se nikdy nedostanou do RNA. Musí existovat vazebné místo pro ribozomy (v bakteriích), takže jakmile jednou přepíšete DNA na mRNA, ribozom z něj „začne mít zájem“ a bude z něj produkovat protein. To by ORF mohlo snadno chybět. Přiznám se, že nejsem žádný odborník na eukaryotickou expresi – struktura chromatinu vše dělá mnohem obtížnějším. A myslím, že existuje spousta transkripčních faktorů atd., Které musí být na správném místě, aby došlo k genové expresi.
Odpověď
Některé z nich kódují RNA, která má nezávislou funkci a není přeložen do proteinu.
Některé z nich kódovaly regulační sekvence pro části, které kódují RNA a proteiny.
Je známo, že alespoň polovina z nich nemá žádnou významnou funkci. Tato část zahrnuje „fosilní“ geny deaktivované mutacemi, inaktivované zbytky virových sekvencí dříve vložených do genomu prostřednictvím virových infekcí v dávné minulosti a parazitické sekvence DNA, které skákají kolem genomu a zanechávají všude další kopie.
Zbývající část nemá žádnou známou funkci, ale pro kterou nebyla vyloučena dosud neznámá funkce.
Poznámka k výsledkům ENCODE zde:
Studie ENCODE skvěle zjistila, že 80\% lidského genomu mělo „biologickou aktivitu“.
„Biologická aktivita“ však NENÍ to samé jako „funkce“.
Studie ENCODE použila a, řekněme, velmi široká, definice „biologické aktivity“. V zásadě, pokud se sekvence přichytila k jakémukoli proteinu s sebemenší afinitou, dokonce i tím nejspecifičtějším způsobem, nebo byla přepsána i v nejmenším stupni, považovala se za „biologicky aktivní“.
Takže starý retro virový sekvence, která si stále uchovala jen tolik své staré promotorové sekvence, aby krátce navázala částečný transkripční komplex, i kdyby taková vazba nebyla dostatečná pro spuštění jakékoli skutečné transkripce, by se v ENCODE počítala jako „biologická aktivita“.
A parazitický skokový gen při kopírování a skákání na nové místo by se počítal jako s „biologickou aktivitou“.
Mrtvý gen s mutací posunu snímku, který produkuje bláznivou mRNA, kterou nelze přeložit na protein kvůli tomu, že nemá žádný kodon START, by se počítal jako „biologicky aktivní“.
Gen s mutací, který produkoval předčasný STOP kodon tak, že se přeloží na zkrácený zlomený protein, který nic nedělá a jen se recykluje by také přišel jako „biologický ly active “.
V každém z těchto případů„ biologické aktivity “by bylo docela těžké tvrdit, že daná sekvence DNA má„ funkci “.