Nejlepší odpověď
ZÁKLADNĚ – Pokud mají dvě molekuly DNA shodné konce, mohou být spojeny enzymem DNA ligáza. DNA ligáza utěsňuje mezeru mezi molekulami a vytváří jediný kousek DNA.
Pokud to chcete podrobně –
Ligáza je jako molekula sešívačka. Jsou všudypřítomné a nezbytné pro všechny buňky a možná vždy. DNA ligáza (polydeoxyribonukleotid syntáza) je enzym, který spojuje dva jednořetězcové fragmenty DNA katalyzováním tvorby inter-nukleotidové esterové vazby mezi fosfátem a deoxyribózou. Je aktivní během replikace DNA, opravy DNA a rekombinace DNA. Existují dvě formy DNA ligázy: jedna vyžaduje ATP a druhá NAD. NAD (+) závislé DNA ligázy jsou přítomny v bakteriích, některých Entomopox virech a Mimi virech, zatímco ATP-dependentní DNA ligázy jsou všudypřítomné.
Pokud dojde k zlomu v jedné z dvouřetězcových DNA, ligázy ligují zlomené končí tvorbou fosfodiesterové vazby mezi zlomenými konci. Používají volnou 5’p nukleotidu jednoho segmentu a volnou 3’OH skupinu sousedního segmentu, po rozpoznání a navázání na ně katalyzují reakci za vzniku kovalentní vazby, čímž uzavírají nick. Aby enzym fungoval, vyžaduje ds DNA s takovými mezerami nebo zářezy v jednom z řetězců. Zářez nebo mezera by mezi konci neměla obsahovat žádný chybějící nukleotid. Minimální délka DNA řetězce ds potřebná pro její funkci je alespoň 4 až 8 párů bází a přerušené vazby by měly být vedle sebe. Pokud chybí více než jeden nukleotid, nebudou to moci udělat. Mnoho DNA ligáz je identifikováno z různých zdrojů, které mají své vlastní specifické znaky, molekulové hmotnosti, požadavky a způsob fungování.
Odpověď
DNA ligáza je enzym, který opravuje nesrovnalosti nebo rozbíjí páteř dvouvláknových molekul DNA. Hraje důležitou roli v procesu replikace a opravy DNA. Má tři obecné funkce: Utěsňuje opravy v DNA, utěsňuje fragmenty rekombinace , a spojuje Okazaki fragmenty (malé fragmenty DNA vytvořené během replikace dvouvláknové DNA ). DNA ligáza funguje tak, že vytváří vazbu mezi koncem „donorového“ nukleotidu a koncem „akceptorového“ nukleotidu.
Existují dva hlavní typy DNA ligázy – první se nachází pouze v prokaryotických buňkách (buňky bez jádra, jako jsou bakterie). Druhý se nachází v eukaryotických buňkách (buňky s jádrem, jako jsou rostliny a zvířata), stejně jako ve virech a bakteriofágech. Dále mají savci čtyři podtypy ligáz, které se liší svou funkcí; Například DNA ligáza III obsahuje protein pro opravu DNA, nazývaný XRCC1, který utěsňuje přerušení řetězce DNA, ke kterému dochází během opravy excizí nukleotidů. Obecně jsou eukaryotické DNA ligázy mnohem větší než jejich prokaryotické protějšky; nejmenší DNA ligáza je produkována bakteriofágem T7.
Protože DNA ligáza hraje tak důležitou roli při pomoci s opravou a replikací DNA, je důležitou součástí experimentů genetické rekombinace, včetně klonování.