Paras vastaus
DNA-replikaation aikana DNA-polymeraasi III on ensisijainen käytetty polymeraasi. Pol III katalysoi vasta syntetisoidun juosteen kasvua reaktion avulla, jossa nukleosidin 3 ”-hydroksyyli (sokeri + emäs ilman fosfaatteja) hyökkää viereisen nukleosiditrifosfaatin 5” -a-fosfaattiin, jossa lähinnä sokeria. Mitä tuloksia on nukleotidin lisääminen polynukleotidiketjuun.
Yllä oleva kuva kuvaa nukleosidin 3 ”hydroksyyliä, joka hyökkää nukleosiditrifosfaatin 5” a-fosfaattia vastaan. Kaksi muuta fosfaattia poistetaan, mikä johtaa nukleotidiin.
Vaikka Pol III: lla on ratkaiseva rooli, se ei kykene sitomaan ja replikoimaan yksijuosteista DNA: ta. Sen sijaan tarvitaan RNA-aluke. Tämä johtuu siitä, että alukkeessa on vapaa 3-hydroksyyliryhmä, joka on jo emäspariksi muodostunut templaattiin. RNA-ketjut sisältävät 5 ”päässä erillisen tunnisteen, joka voi olla joko pppG tai pppA . Tämän avulla sen synteesi voi alkaa DNA-juosteen 5 ”päästä ja jatkaa 3” suuntaan.
RNA-primaasi lukee lyhyen osan vanhemman DNA-juosteesta ja luo komplementaarisen 10-12 nukleotidialukkeen. Aluke toimii lähtökohtana jossa Pol III sitoutuu ja aloittaa tytärjuoksen synteesin.
Kun tarkastelet yllä olevaa kuvaa, huomaa, että ppp jää RNA-ketjun 5 ”päähän silloinkin, kun Pol III sitoutuu.
Kuten replikaatio päättyy, DNA-polymeraasi I poistaa RNA-alukkeen ja täyttää sen DNA: lla.
Vastaus
DNA-polymeraasit eivät voi aloittaa DNA-synteesiä – ne voivat lisää vain olemassa olevaan DNA- tai RNA-juosteeseen. Olemassa olevan juosteen sanotaan ”aloittavan” DNA-synteesin. RNA-polymeraasit voivat kuitenkin alkaa kopioida vanhemman juosteen ilman aluketta – aivan kuten ne tekevät geenien transkriptiossa. DNA-replikaation aikana RNA-alukkeita tuotetaan RNA-polymeraaseilla, jotta saadaan lähtökohta DNA-polymeraaseille, joista voi ulottua.