Beste antwoord
BASIS – Als twee DNA-moleculen overeenkomende uiteinden hebben, kunnen ze worden vergezeld door het enzym DNA-ligase. DNA-ligase dicht de kloof tussen de moleculen af en vormt een enkel stuk DNA
Voor het geval je het in detail wilt –
Ligase is als een molecuul stitcher. Ze zijn alomtegenwoordig en essentieel voor alle cellen en misschien wel altijd. DNA-ligase (polydeoxyribonucleotidesynthase) is het enzym dat twee enkelstrengs DNA-fragmenten verbindt door de vorming van een inter-nucleotide-esterbinding tussen fosfaat en deoxyribose te katalyseren. Het is actief tijdens DNA-replicatie, DNA-reparatie en DNA-recombinatie. Er zijn twee vormen van DNA-ligase: de ene vereist ATP en de andere NAD. NAD (+) afhankelijke DNA-ligasen zijn aanwezig in bacteriën, sommige Entomopox-virussen en het Mimi-virus, terwijl ATP-afhankelijke DNA-ligasen alomtegenwoordig zijn.
Als er een breuk is in een van de dubbelstrengs DNA, ligasen het gebroken eindigt door vorming van fosfodiësterbindingen tussen de gebroken uiteinden. Ze gebruiken de vrije 5p van een nucleotide van één segment en de vrije 3OH-groep van het aangrenzende segment, nadat ze deze hebben herkend en eraan gebonden, katalyseren ze de reactie om een covalente binding te vormen, waardoor ze de inkeping verzegelen. Om het enzym te laten functioneren, heeft het ds-DNA nodig met dergelijke gaten of inkepingen in een van de strengen. De inkeping of de opening mag geen ontbrekend nucleotide tussen de uiteinden bevatten. Een minimale lengte van het DNA van de ds-streng die nodig is voor zijn functie is ten minste 4 tot 8 basenparen en de verbroken bindingen moeten naast elkaar liggen. Als er meer dan één nucleotide ontbreekt, kunnen ze dat niet doen. Veel DNA-ligasen worden geïdentificeerd uit verschillende bronnen, die hun eigen specifieke karakters, molecuulgewichten, vereisten en modus van functies hebben.
Antwoord
DNA-ligase is een enzym dat repareert onregelmatigheden of breekt in de ruggengraat van dubbelstrengs DNA-moleculen. Het speelt een belangrijke rol in het proces van DNA-replicatie en DNA-reparatie. Het heeft drie algemene functies: het verzegelt reparaties in het DNA, het verzegelt recombinatie fragmenten, en het verbindt Okazaki fragmenten (kleine DNA-fragmenten gevormd tijdens de replicatie van dubbelstrengs DNA ). DNA-ligase functioneert door een binding te vormen tussen het uiteinde van een “donornucleotide” en het einde van een “acceptornucleotide”.
Er zijn twee hoofdtypen DNA-ligase – de eerste wordt alleen aangetroffen in prokaryote cellen (cellen zonder kern, zoals bacteriën). De tweede wordt gevonden in eukaryote cellen (cellen met een celkern, zoals die van planten en dieren) en in virussen en bacteriofagen. Bovendien hebben zoogdieren vier subtypes van ligasen die variëren in hun functie; DNA-ligase III bevat bijvoorbeeld een DNA-reparatie-eiwit, XRCC1 genaamd, dat de breuk in de DNA-streng afdicht die optreedt tijdens nucleotide-excisieherstel. In het algemeen zijn eukaryote DNA-ligasen veel groter dan hun prokaryote tegenhangers; de kleinste DNA-ligase wordt geproduceerd door de bacteriofaag T7.
Omdat DNA-ligase zon belangrijke rol speelt bij het helpen bij DNA-herstel en replicatie, is het een belangrijk onderdeel van genetische recombinatie-experimenten, inclusief klonen.