Melhor resposta
O PDF é transparente por padrão. A cor de fundo é feita pelo seu aplicativo. Ligue este pequeno gatilho em Acrobat / Configurações e você ficará surpreso.
Obrigado a Thomas Phinney, que forneceu o inglês versão da captura de tela.
Abaixo está a captura de tela da versão alemã do Acrobat DC:
Esta é a aparência do Acrobat:
Resposta
Maneira mais fácil? Como você está medindo facilmente? Se o arquivo original não tiver fundo, basta exportar o arquivo como PDF. Dependendo do aplicativo que você está usando para exportar o PDF também afetará o resultado final.
Você também pode criar o arquivo original sem fundo ou abrir o PDF no Photoshop e salvar o formato do arquivo como um PSD ou PNG.