Co jsou enzymy hydrolyzující bílkoviny běžně známé jako? Proč?

Nejlepší odpověď

Proteáza je termín používaný pro enzymy hydrolyzující bílkoviny. Jedna z nejstarších konvencí pojmenování v biochemii je tato – když enzym způsobí, že něco „zmizí“ hydrolýzou nebo přidáním vody, pojmenujete to, co „zmizí“ a přidáte -ase. Fumaráza způsobí odchod fumarátu (jeho hydratací), laktáza způsobí odchod laktózy (hydrolýzou). Proteázy způsobují, že bílkoviny odcházejí tak, že je rozsekají na peptidy a aminokyseliny. Níže uvedený odkaz na Wikipedii jde o něco podrobněji.

Proteáza

Odpovědět

Důvodem je jemná změna na aktivním webu. Díky tomu funguje model indukovaného přizpůsobení. Pokud by nezměnilo své uložení, nevázalo by se správně. Když se produkt (produkty) uvolní, enzym se vrátí do své nenavázané konformace a je připraven na další katalytický obrat.

Nosič kyslíku ve svalech, myoglobin a v krevních buňkách, tetramer hemoglobin, se chová takto způsobem.

Tyto proteiny nemají velký substrát (je to jen plynný O2). Ale když se váže, táhne distální histidin nahoru, což způsobí, že komplex Fe-porfyrin změní konformaci celého proteinu z klenuté ( odkysličený) na planární (okysličený).

Když to uděláte, krev začne být jasně červená (je arteriální, ne žilní) . Tvar zde může být zřetelnější: tmavě červená až rovinná.

Vazba O2 spojuje 2 histidiny dohromady. (CO a Vazby na CN pevněji než na O2 – což může být fatální, pokud je fit příliš dobrý nebo nevratný – nazývané kompetitivní inhibice . CO a CN- (kyanid) by neměly být tam, ale také se hodí.

Substrát a d jeho vazebné složení mění konformaci. Není to jedno nebo druhé, jsou to obojí.

Se všemi extra odstraněnými kvůli srozumitelnosti jsou na aktivním webu specializované zbytky, jak jste možná uhodli. Dva histidinové zbytky v hemoglobinu a myoglobinu (proximální a distální) kolem koordinační sféry Fe vázané na hem a umožňují naložení kyslíku a jeho transport do svalů a v případě potřeby jej uvolňují.

Něco takového se děje na každém aktivním webu a indukuje lepší přizpůsobení mezi aktivním webem a substrátem dohromady .

Animace: Phlab: Pearson publishing.

Fotografie: Wikimedia Commons.