Bedste svar
Protease er det udtryk, der bruges til proteinhydrolyserende enzymer. En af de ældste navngivningskonventioner inden for biokemi er dette – når et enzym får noget til at ”gå væk” ved at hydrolysere eller tilføje vand, navngiver du det, der “forsvinder” og tilføjer -ase. Fumarase får fumarat til at forsvinde (ved hydrering af det), Lactase får lactose til at forsvinde (ved at hydrolysere det). Proteaser får proteiner til at forsvinde ved at hugge dem op i peptider og aminosyrer. Wikipedia-linket nedenfor går lidt mere i detaljer.
Svar
Subtile ændringer på det aktive sted er årsagen. Dette er, hvad der får den inducerede pasformsmodel til at fungere. Hvis det ikke ændrede sin pasform, ville det ikke binde ordentligt. Når produktet / produkterne frigives, går enzymet tilbage til sin ubundne konformation og er klar til en anden katalytisk omsætning.
Iltbæreren i muskler, myoglobin og i blodcellerne, tetramerhæmoglobinet, opfører sig dette måde.
Disse proteiner har ikke et stort substrat (det er bare O2-gas). Men når det binder, trækker det et distalt histidin opad, hvilket får Fe-porphyrin-komplekset til at ændre hele proteinets konformation fra kuplet ( deoxygeneret) til plan (iltet).
Når det gør dette, bliver blodet rødt rødt (det er arterielt, ikke venøst) Formen kan være mere åbenbar her: mørkerød indtil plan.
O2-binding bringer de 2 histidiner sammen. (CO og CN- binder tættere end O2 – hvilket kan være fatalt, hvis pasformen er for god eller irreversibel – kaldet konkurrencemæssig hæmning . CO og CN- (cyanid) bør ikke være derinde, men de passer også.
Underlaget og d dens bindingssammensætning ændrer konformationen. Det er ikke det ene eller det andet, det er begge dele.
Med alt det ekstra fjernet for klarhedens skyld er der specialiserede rester på det aktive sted, som du måske har gættet. De to histidinerester i hæmoglobin og myoglobin (proksimal og distal) omkring koordinationssfæren af Fe bundet til hæm og tillader belastning af O2 og transport af det til musklerne, hvorved det frigives, hvor det er nødvendigt.
Noget som dette sker i hvert aktivt sted og inducerer en bedre pasform mellem det aktive sted og substratet sammen .
Animation: Phlab: Pearson publishing.
Fotos: Wikimedia Commons.