Beste svaret
Protease er betegnelsen som brukes for proteinhydrolyserende enzymer. En av de eldste navngivningskonvensjonene innen biokjemi er dette – når et enzym får noe til å «forsvinne» ved å hydrolysere eller tilsette vann, kaller du det som «forsvinner» og legger til -ase. Fumarase får fumarat til å forsvinne (ved å hydrere det), Laktase gjør at laktose forsvinner (ved å hydrolysere det). Proteaser får proteiner til å forsvinne ved å hugge dem opp i peptider og aminosyrer. Wikipedia-lenken nedenfor går litt mer i detalj.
Svar
Subtil endring på det aktive nettstedet er årsaken. Dette er det som får den induserte passformmodellen til å fungere. Hvis det ikke endret passform, ville det ikke binde seg ordentlig. Når produktet / produktene frigjøres, går enzymet tilbake til sin ubundne konformasjon og er klar for en ny katalytisk omsetning.
Oksygenbæreren i muskler, myoglobin og i blodcellene, tetramerhemoglobinet, oppfører seg slik måte.
Disse proteinene har ikke et stort substrat (det er bare O2-gass). Men når det binder, drar det et distalt histidin oppover og forårsaker at Fe-porfyrinkomplekset endrer hele proteinets konformasjon fra kuppel ( deoksygenert) til planar (oksygenert).
Når det gjør dette blir blodet rødrødt (det er arterielt, ikke venøst) Formen kan være mer åpenbar her: mørk rød til plan.
O2-binding bringer de 2 histidinene sammen. (CO og CN-bind tettere enn O2 – som kan være dødelig hvis passformen er for god eller irreversibel – kalt konkurransedyktig hemming . CO og CN- (cyanid) bør ikke være der, men de passer også.
Underlaget og d bindesammensetningen endrer konformasjonen. Det er ikke det ene eller det andre, det er begge deler.
Med alt det ekstra som er fjernet for klarhet, er det spesialrester på det aktive nettstedet, som du kanskje har gjettet. De to histidinerester i hemoglobin og myoglobin (proksimal og distal) rundt koordinasjonssfæren til Fe bundet til hem og tillater belastning av O2 og transport av den til muskler, og frigjør den der det er behov.
Noe som dette skjer i hvert aktive sted og induserer en bedre passform mellom det aktive stedet og underlaget sammen .
Animasjon: Phlab: Pearson-publisering.
Bilder: Wikimedia Commons.