'系統発生制約'とはどういう意味ですか?


ベストアンサー

編集:系統発生制約には明らかに複数の定義があります。 1つは基本的なボディープランに関するもので、もう1つは系統樹の再構築に使用されます。私の答えは2番目の定義に関するものです。

計算系統発生学の分野を穏やかに紹介しようとした後、系統発生学の制約とは何かを説明します。

系統発生学は研究です。一連の種の進化の歴史の再構築に関係する分野。この進化の歴史は、系統樹としても知られる木の形をとると想定されています。このトピックのロゴでもあるダーウィンの有名なイラストは、そのような系統樹の1つの例です。

系統樹の葉は通常、今日存在する種です。各葉は枝で木に接続されています。葉のペアを選んでその枝をたどると、単一の分岐点に到達します。この内部分岐点は、これら2つの葉の最新の共通の祖先です。同じ論理で、根はすべての葉の祖先です。

系統発生コミュニティで非常に興味深いトピックは、根からすべての子孫に進化した情報を使用して系統樹を再構築することです。 。たとえば、すべての種に存在する特定の遺伝子の配列を調べることができます。この遺伝子が祖先から子孫に進化するにつれて、その配列の変化を蓄積します。次に、シーケンスの各ペアがどれほど類似しているかを比較し、最も可能性の高い系統樹を構築しようとします。

最適なツリーを見つける方法はたくさんあります。 1つの方法は、考えられるすべてのツリーを検索し、それぞれにスコアを付けてから、スコアが最も高いツリーを選択することです。これは特に厄介な問題です。検索する必要のある木の数が天文学的に多いためです。

種のサブセットが密接に関連するサブグループを形成することが事前にわかっている場合は、この種のサブセットがサブツリーを形成するツリーのみを検索するように検索アルゴリズムを制約できます。

系統樹のトポロジーに対するこの制約は、系統発生の制約です。このような制約を設定すると、検索アルゴリズムが考慮する必要のあるツリーの数が減り、最適なツリーの検索にかかる時間が短縮されます。

このようなサブツリーの例については、ウィキペディアで単系統群とクレードを調べてください。

回答

あなたの質問には、回答する前に明確にしておきたい誤解がいくつかあります。

まず、「断続平衡説」は実際には「新しい」理論ではありません。ダーウィンは150年以上前にその可能性を認識していました。 「断続平衡説」はダーウィンの理論の「代替」ではなく、それを改良したものです。 P.E.基本的に、形態学的の変化率は一定ではないと述べています。系統は、より困難な環境にあるときに急速な形態変化を起こし、個体群がその環境に適した状態になると相対的な形態学的停滞に落ち着くことがあります。そのため、形態の一定の、ゆっくりとした、段階的な変化はありませんが、不規則です変化する「テンポ」は、時には速く、時には遅くなります。

たとえば、人口が森林から草地に拡大した場合、すでに森林に順応している個人はかなり安定していますが、草地に移動した人口ははるかに速く変化します。

草地の人口は、ダーウィンの「漸進的」プロセスを通じて「ゆっくり」変化していますが、残った「いとこ」よりも速く変化しています。森の中。 P.E.一部の環境では、他の環境とは異なる「テンポ」または「速度」で選択が行われるという認識にすぎません。

2番目: 「ミッシングリンク」の概念は、「存在の大いなる連鎖」に対する古代(実際には古典的なギリシャ語)の信念に基づいていますが、その可能性は含まれていませんでした。まったく進化の。完全に近い順序で異なる種を「ランク付け」できるというのは、単なる仮定でした。種は、 関連です。 「存在の大いなる連鎖」は、すべての種が「固定され、不変」であり、サメはトラよりも「優れている」、またはウサギはリンゴの木よりも「優れている」と言う方法があると想定していました。

ほとんどの場合、「存在の大いなる連鎖」は、「私がクールで良いので、私に似ている方が良い」と示唆していました。

それは人間でした。ナルシシズム、そしてそれ以上のものはありません。

3番目:「大進化」は、それ以上でもそれ以下でもありません。小さな変化がたくさんあるという理解に他なりません。 大きな違いにつながる可能性があります。 一歩踏み出せば、あなたは「マイクロウォーク」を旅したことになります。 5000歩歩くと、1マイル歩きました。 1マイルは、ステップからの距離の 種類 と同じです。 これは、 ステップの量 の違いです。

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