O que se entende por ' restrição filogenética '?


Melhor resposta

Editar: Existem aparentemente várias definições de restrição filogenética. Um referente à planta básica do corpo e outro que é usado na reconstrução da árvore filogenética. Minha resposta é com relação à segunda definição.

Eu tentei introduzir suavemente o campo da filogenética computacional, após o que eu procuro explicar o que é uma restrição filogenética.

Filogenética é a pesquisa campo preocupado com a reconstrução da história evolutiva de um conjunto de espécies. Esta história evolutiva assume a forma de uma árvore, também conhecida como árvore filogenética. A famosa ilustração de Darwin, que também é o logotipo deste tópico, é um exemplo de uma dessas árvores filogenéticas.

As folhas da árvore filogenética são geralmente espécies que existem hoje. Cada folha está conectada à árvore por um galho. Se você escolher qualquer par de folhas e seguir seus galhos, chegará a um único ponto de ramificação. Este ponto de ramificação interno é o ancestral comum mais recente dessas duas folhas. Pela mesma lógica, a raiz é o ancestral de todas as folhas.

Um tópico de grande interesse na comunidade filogenética é reconstruir a árvore filogenética usando algumas informações que evoluíram da raiz para todos os descendentes . Por exemplo, pode-se olhar para a sequência de um determinado gene que está presente em todas as espécies. À medida que esse gene evolui de ancestral para descendente, ele acumula mudanças em suas sequências. Podemos então comparar a semelhança de cada par de sequências e tentar construir a árvore filogenética mais provável.

Existem muitas maneiras de tentar encontrar a melhor árvore. Uma maneira é pesquisar entre todas as árvores possíveis, pontuando cada uma delas e, em seguida, selecionando a árvore com a melhor pontuação. Este é um problema particularmente desagradável porque o número de árvores que se deve pesquisar é astronomicamente grande.

Se alguém sabe de antemão que um subconjunto de espécies forma um subgrupo intimamente relacionado, pode-se restringir o algoritmo de pesquisa para procurar apenas as árvores em que esse subconjunto de espécies forma uma subárvore.

Esta restrição na topologia da árvore filogenética é a restrição filogenética. Colocar tais restrições reduz o número de árvores que o algoritmo de pesquisa deve considerar e, portanto, reduz o tempo gasto na pesquisa da melhor árvore.

Procure monofilia e clados na Wikipédia para exemplos ilustrativos dessas subárvores.

Resposta

Existem alguns equívocos implícitos em sua pergunta que quero esclarecer antes de responder.

Primeiro , “Equilíbrio pontuado” não é realmente uma “nova” teoria. Darwin estava ciente dessa possibilidade há mais de 150 anos. “Equilíbrio pontuado” não é uma “alternativa” à teoria de Darwin, mas um refinamento dela. educaçao Fisica. afirma basicamente que a taxa de alteração morfológica não é constante; às vezes, as linhagens passam por mudanças morfológicas rápidas quando estão em ambientes mais desafiadores e, em seguida, se estabelecem em relativa estase morfológica uma vez que a população se torna bem adequada a esse ambiente, de modo que não há uma mudança constante, lenta e gradual na morfologia, mas sim uma “Ritmo” para mudar que às vezes é mais rápido, às vezes mais lento.

Se uma população se expande de uma floresta para uma pastagem, por exemplo, os indivíduos que já estão bem adaptados à floresta permanecerão bastante estáveis, mas a população que se mudou para as pastagens mudará muito mais rápido.

A população das pastagens ainda está mudando “lentamente”, por meio do processo darwiniano de “gradualismo”, mas estão mudando mais rápido do que seus “primos” que permaneceram na floresta. educaçao Fisica. é apenas um reconhecimento de que a seleção ocorre em um “tempo” ou “velocidade” diferente em alguns ambientes do que em outros.

Segundo: o noção de um “elo perdido” é baseada em uma crença antiga (na verdade, grego clássico) em uma “ Grande Cadeia do Ser ”, que não incluía a possibilidade de evolução em tudo. Era simplesmente uma suposição de que diferentes espécies poderiam ser “classificadas” em uma ordem de aproximação à perfeição. Presumiu-se que as espécies pudessem ser classificadas em grupos de acordo com o quanto gostamos delas, em vez da ordem de relacionados eles são. A “Grande Cadeia do Ser” presumia que todas as espécies eram “fixas e imutáveis” e que tínhamos uma maneira de dizer que um tubarão era “melhor” que um tigre, ou um coelho coelhinho era “melhor” que uma macieira.

Na maior parte, a “grande corrente do ser” sugeria que “se for mais parecido comigo, é melhor, porque sou legal e bom”. narcisismo e nada mais.

Terceiro: “Macroevolução” não é nada mais, nada menos e nada mais do que o entendimento de que um monte de pequenas mudanças pode fazer uma grande diferença. Se der um passo, você fez uma “micro caminhada”. Se você der 5000 passos, você andou uma milha. Uma milha não é um tipo diferente de distância de um degrau. É uma diferença de valores de etapas.

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